Phú Quốc nằm ở vị trí đặc biệt (cửa ngõ gió mùa Tây Nam), thuộc khí hậu nhiệt đới gió mùa cận xích đạo. Nhiệt độ trung bình năm chỉ 25-27,7°C (ban ngày cao nhất trung bình 31,2°C, ban đêm thấp nhất 24,6°C). Độ ẩm trung bình quanh năm ~80%.
- Mùa khô: Cuối tháng 10/tháng 11 đến tháng 4 năm sau (chiếm phần lớn năm).
- Mùa mưa: Tháng 5 đến tháng 9/10.
Lượng mưa trung bình năm khoảng 190mm/tháng, nhưng phân bố cực kỳ không đều: mùa khô chỉ 43mm/tháng (tháng 11-3), mùa mưa lên tới 361-414mm/tháng. Phú Quốc hiếm khi chịu bão trực tiếp nhờ vị trí vịnh Thái Lan, nhưng gió mạnh và mưa rào có thể xảy ra.



