Алтарь Намзяо был заложен в 1806 году и завершен в 1807 году в эпоху правления императора Gia Long. Церемония жертвоприношения Намзяо (поклонение Небу и Земле) являлась важнейшим ритуалом феодального строя, поскольку согласно конфуцианским канонам император считался «Сыном Неба», правящим народом по воле свыше. Поэтому обряд жертвоприношения был не только духовным действом, но и политическим актом, укреплявшим верховную власть и статус правителя.

С 1807 по 1885 год ритуал жертвоприношения проводился регулярно раз в год весной. Позже, с 1891 года, его стали устраивать раз в три года. Последняя церемония династии Нгуен на этом месте состоялась в 1945 году.
После падения династии Нгуен алтарь Намзяо постепенно пришел в запустение и сильно пострадал в ходе двух войн. В 1977 году на фундаменте Круглого алтаря был воздвигнут мемориал павшим воинам, что вызвало волну общественного недовольства. Лишь в 1992 году этот памятник был перенесен, после чего начались активные работы по реставрации и возрождению Намзяо. В 1993 году алтарь Намзяо был внесен ЮНЕСКО в список объектов Всемирного культурного наследия, что стало важной вехой в сохранении и восстановлении этого исторического комплекса.

