慈昙寺历史悠久,始建于17世纪。大约在1690年阮福淍(Nguyen Phuc Chu)主政时期,寺庙由来自中国的溟弘子容(Minh Hoang Tu Dung)禅师开山创立,初名为“印宗寺”。该禅师隶属于临济宗,建寺旨在为当时的佛教社群提供修持之所。到了1841年绍治皇帝统治时期,寺庙取佛经中“慈”与“昙”二字之意,正式更名为“慈昙寺”,象征着慈悲与清净。
历经历史的风云变幻,顺化慈昙寺在20世纪30年代成为了中圻佛教振兴运动的中心。1932年,安南佛学会(后更名为中越佛学会)在此成立,并于1936年正式将该寺作为学会总部。特别是,该寺与1963年的佛教运动紧密相连,寺内庭院曾是数千民众集会的场所,在越南佛教历史上写下了重要篇章。1935年,在佛教振兴运动蓬勃发展的背景下,寺庙得以修缮扩建。至2006年,寺庙再次进行了大规模修缮,在完好保留历史价值的同时融入了现代元素。

如今,慈昙寺作为顺化市佛教治事委员会的办公驻地,同时也是举办各类重大佛教大会、会议和节庆活动的场所。院中庄严神圣的菩提树,至今仍是承天顺化省佛教发展生生不息的象征。

