根据现存的历史文献与碑铭记载,三台寺始建于约1630年(后黎朝时期),当时内路正逐渐成为繁荣的商贸与文化交汇地。三台寺最初仅是一座建在山间的小寺,后来逐渐成为多代僧侣修行与弘法的道场,其中包括17世纪末在内路佛教史上颇具声望的兴莲禅师。
据史料记载,兴莲禅师在将曹洞禅派传入内路并在三台寺开辟道场方面发挥了重要作用。自此,这座寺庙不仅承担着供奉佛陀的神圣职能,还在当时的佛教生活中占据了重要地位。“三台”这一名称源于其独特的山势地貌。水山顶峰的三座小山丘层叠相依,形成三层地貌,在古代天文学中宛如“三台星”并列。

三台寺的历史亦历经沧桑变迁。西山朝时期,寺庙遭受战火严重破坏。至1825年明命年间,寺庙得以大规模重修。明命帝钦赐其为国寺,并御赐“御制三台寺”匾额及刻有御笔题词的火焰心形金牌。这些珍贵遗迹至今仍妥善保存在寺内。
此后,三台寺又经历了数次毁损与修缮。1901年的一场特大风暴几乎将整座建筑摧毁;至1907年,在僧尼与十方信众的共同捐助下,寺庙得以重建。经过1964年、1968年、1995至1996年以及随后的多次修葺,古刹建筑得以保存至今,依然保留着数百年来矗立于水山之上的古朴风貌。


