Phu Quoc bénéficie d'une situation géographique privilégiée (à l'entrée de la mousson du sud-ouest) et d'un climat tropical de mousson subéquatorial. La température moyenne annuelle se situe entre 25 et 27,7 °C (moyenne maximale en journée de 31,2 °C, minimale nocturne de 24,6 °C). Le taux d'humidité moyen oscille autour de 80 % tout au long de l'année.
- Saison sèche : De fin octobre/novembre à avril de l'année suivante (la majeure partie de l'année).
- Saison des pluies : De mai à septembre/octobre.
Les précipitations moyennes s'élèvent à environ 190 mm/mois, mais sont réparties de manière très inégale : seulement 43 mm/mois en saison sèche (novembre à mars), contre 361 à 414 mm/mois durant la saison des pluies. Phu Quoc subit rarement des typhons directs grâce à son emplacement abrité dans le golfe de Thaïlande, bien que des vents violents et de fortes averses puissent survenir.



