Hoi An presenta un clima tropicale monsonico, con temperature calde per quasi tutto l'arco dell'anno. La temperatura media si aggira intorno ai 25–27°C, scendendo raramente sotto i 18°C o superando i 36–37°C. L'umidità è generalmente elevata, attorno al 75–90%, motivo per cui le giornate estive possono apparire più calde rispetto alla temperatura reale.
Il clima di Hoi An si suddivide in due stagioni distinte, ciascuna delle quali conferisce un aspetto unico all'antica cittadina.
Stagione secca (da febbraio ad agosto circa): Il clima è relativamente asciutto e soleggiato con scarse precipitazioni, ideale per attività all'aperto, visite all'antico centro storico, passeggiate in bicicletta, esplorazioni delle campagne e soggiorni al mare.
Stagione delle piogge (da settembre a gennaio circa): Le precipitazioni diventano più frequenti, concentrandosi soprattutto nei mesi di ottobre e novembre. È anche il periodo in cui Hoi An può essere interessata da tifoni, depressioni tropicali e allagamenti locali, in particolare nella zona della città vecchia.
La piovosità media annua si attesta intorno ai 2.000–2.500 mm, concentrandosi perlopiù negli ultimi mesi dell'anno. Al contempo, il mare di Hoi An mantiene temperature piacevoli, intorno ai 23–30°C, offrendo condizioni favorevoli per la balneazione dalla fine della primavera fino a tutta l'estate.



