Das Quoc Tu Giam in Hue wurde im Jahr 1803 gegründet, unmittelbar nachdem König Gia Long das Land geeint und Hue zur Hauptstadt ernannt hatte. Ursprünglich trug die Schule den Namen Doc Hoc Duong (oder Quoc Hoc Duong) und befand sich im Weiler An Ninh Thuong, Bezirk Huong Tra (heute Dorf An Binh, Stadtteil Kim Long). Die Anlage lag neben dem Literaturtempel und bot einen direkten Blick auf den Parfüm-Fluss – ein Standort, der nach den konfuzianischen Feng-Shui-Prinzipien gewählt wurde: nah am Wasser, weitläufig und in vollkommener Harmonie mit der Natur.
Im Jahr 1820 benannte König Minh Mang die Schule in Quoc Tu Giam um und leitete damit eine Blütezeit des Bildungswesens unter der Nguyen-Dynastie ein. Bereits ein Jahr später wurde die Anlage erweitert: Die Di-Luan-Duong-Halle entstand als zentraler Hörsaal, flankiert von zwei Unterrichtsflügeln mit jeweils 19 Räumen. Unter König Tu Duc (1848–1854) wurde die Schule um ein 9-räumiges Gebäude, eine Ziegelumfassungsmauer, Studentenunterkünfte und zwei separate Nebentore für die Gelehrten ergänzt. Im Jahr 1854 verfasste König Tu Duc zudem einen Text und ein Gedicht, die auf einer Stele im Innenhof eingraviert wurden, um den hohen Stellenwert von Wissen und Bildungstradition zu würdigen.

Die Akademie erlitt 1904 durch einen Taifun schwere Schäden, wurde jedoch anschließend restauriert. Im Jahr 1908, unter König Duy Tan, wurde das Quoc Tu Giam in das Innere der kaiserlichen Zitadelle verlegt (an seinen heutigen Standort an der Straße 23 Thang 8), um die Verwaltung und die Durchführung von Zeremonien zu erleichtern. Im Jahr 1923 wurde das Tan Tho Vien zum Khai-Dinh-Museum umgestaltet, während hinter der Di-Luan-Duong-Halle eine neue Bibliothek namens Bao-Dai-Bibliothek errichtet wurde. Das Quoc Tu Giam blieb bis 1945 in Betrieb, als mit dem Ende der Nguyen-Dynastie auch das traditionelle konfuzianische Bildungswesen offiziell endete.
In den über 120 Jahren seines Bestehens brachte das Quoc Tu Giam in Hue mehr als 500 Doktoren und Vizedoktoren hervor. Es zog Gelehrte aus allen Landesteilen an, darunter Angehörige der kaiserlichen Familie, Beamtensöhne sowie herausragende Studenten und Absolventen der Regionalprüfungen. Die erste kaiserliche Palastprüfung fand 1822 statt; die Namen der erfolgreichen Absolventen wurden auf Stelen im benachbarten Literaturtempel verewigt.


