La pagode Tu Dam possède une longue histoire qui remonte au XVIIe siècle. À l'origine, elle a été érigée vers 1690 sous le règne du seigneur Nguyen Phuc Chu, sous le nom initial de pagode An Ton, fondée par le maître zen Minh Hoang Tu Dung, un moine d'origine chinoise. Ce maître zen appartenait à l'école Linji, et la pagode fut construite pour servir la communauté bouddhiste de l'époque. En 1841, sous le règne de l'empereur Thieu Tri, la pagode fut rebaptisée Tu Dam, s'inspirant des deux termes bouddhiques « Tu » et « Dam », symbolisant la compassion et la pureté.
Traversant de nombreuses vicissitudes historiques, la pagode Tu Dam à Hue est devenue le centre du mouvement de renouveau bouddhiste en Annam dans les années 1930. En 1932, l'Association des études bouddhiques d'Annam (devenue plus tard l'Association des études bouddhiques du Centre-Vietnam) y a été fondée, et en 1936, la pagode en est devenue officiellement le siège. La pagode est particulièrement liée à la crise bouddhique de 1963, lorsque sa cour a rassemblé des milliers de fidèles et de citoyens, marquant une page mémorable de l'histoire du bouddhisme vietnamien. En 1935, elle a fait l'objet d'une importante restauration dans le cadre de ce renouveau bouddhique. En 2006, d'autres travaux de rénovation majeurs ont été entrepris, préservant ses valeurs historiques tout en intégrant des éléments modernes.
Aujourd'hui, la pagode Tu Dam abrite le bureau du comité exécutif de la communauté bouddhiste de la ville de Hue, tout en accueillant de grands congrès, conférences et célébrations bouddhistes. L'arbre de la Bodhi sacré au milieu de la cour demeure le symbole de l'épanouissement du bouddhisme à Thua Thien Hue.
