Kiến trúc chùa Bái Đính là sự kết hợp hoàn hảo giữa lối kiến trúc Việt Nam cổ điển và quy mô hiện đại, tạo nên vẻ đẹp nguy nga, tráng lệ. Được thiết kế bởi Giáo sư Hoàng Đạo Kính, chùa mang hình khối lớn, mái cong vút hình đuôi chim phượng – đặc trưng của kiến trúc Việt, khác biệt với mái thẳng của Trung Quốc. Vật liệu xây dựng chủ yếu là đá xanh Ninh Bình, gỗ tứ thiết cho cột kèo, bê tông giả gỗ cho các công trình lớn, và ngói men Bát Tràng màu nâu sẫm. Bố cục chùa được sắp xếp từ thấp lên cao theo đường chính đạo, với 5 cấp: Tam Quan nội, tháp chuông, điện Quan Âm, điện Pháp Chủ và điện Tam Thế. Chiều cao mái các điện tăng dần: 16.5 m (Tam Quan), 22 m (Tháp Chuông), 14.8 m (Điện Quan Âm), 30 m (Điện Pháp Chủ), và 34 m (Điện Tam Thế).
Khu chùa cổ (Bái Đính cổ tự)
- Vị trí: Nằm trên ngọn núi cao 187m, cách khu chùa mới khoảng 800m.
- Đặc điểm: Khu chùa cổ có lịch sử gần 1000 năm, được phát hiện và xây dựng bởi Thiền sư Nguyễn Minh Không vào thời nhà Lý.
- Kiến trúc: Mang lối kiến trúc chùa động phổ biến ở Ninh Bình. Thay vì mái cong, trụ cột đồ sộ, các ban thờ Phật, thờ Mẫu được đặt sâu trong lòng các sơn động u minh (như hang sáng thờ Phật, động tối thờ Mẫu và Tiên), tạo nên không khí linh thiêng và huyền bí.
- Ý nghĩa: Đây là nơi Vua Đinh Tiên Hoàng lập đàn tế trời, là nơi Nguyễn Minh Không tìm cây thuốc chữa bệnh hóa hổ cho Vua Lý Thần Tông. Vua Lê Thánh Tông khi kinh lý qua đây đã đề tặng bốn chữ “Minh Đỉnh danh lam” ca ngợi vẻ đẹp nơi này.
- Di tích: Chùa Bái Đính cổ được công nhận là Di tích lịch sử - văn hóa - cách mạng cấp quốc gia vào năm 1997.

Khu chùa mới (Bái Đính tân tự)
- Quy mô: Khởi công xây dựng từ năm 2003, có diện tích rộng 80 ha, nổi bật giữa thung lũng hồ và núi đá.
- Kiến trúc: Đồ sộ, hoành tráng nhưng mang đậm dấu ấn kiến trúc Việt Nam. Nét khác biệt lớn nhất là vòm mái màu nâu sẫm, cong hình đuôi chim phượng.
- Vật liệu: Sử dụng các nguyên vật liệu chính ở địa phương như đá xanh Ninh Bình, gỗ tứ thiết, và ngói men Bát Tràng màu nâu sẫm, thể hiện sự kết hợp tinh hoa của các làng nghề truyền thống nổi tiếng.
- Các công trình chính: Điện Tam Thế, Điện Pháp Chủ, Điện Quan Âm, Bảo Tháp, Tháp Chuông, Hành lang La Hán…
Dù là vẻ đẹp cổ kính, trầm mặc của chùa động hay sự uy nghi, hoành tráng của kiến trúc mới, sự kết hợp giữa hai khu vực đã tạo nên một quần thể Bái Đính vừa giàu giá trị lịch sử, tâm linh, vừa là kỳ quan kiến trúc độc đáo của Việt Nam.

